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融智生物:MALDI-TOF MS會(huì)不會(huì)取代形態(tài)學(xué)
鑒定?

發(fā)布時(shí)間:2021-1-20     來(lái)源:融智生物科技(青島)有限公司

分子生物學(xué)興起之前,人們對(duì)自然界生物的分類主要依靠形態(tài)學(xué)鑒定。比如對(duì)于植物,是從根、莖、葉、花、果實(shí)等方面進(jìn)行形態(tài)學(xué)描述,再根據(jù)這些形態(tài)學(xué)描述,對(duì)未知植物的物種進(jìn)行確認(rèn)。但是,這些工作需要十分有經(jīng)驗(yàn)的專業(yè)人士來(lái)完成。

分子生物學(xué)的出現(xiàn),不斷改變著這種格局。對(duì)于肉眼難以觀察的微生物等生物,從形態(tài)學(xué)上難以確認(rèn)其物種,此時(shí),分子生物學(xué)就首先成為了主流的物種鑒定方式。

基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)的介入,使細(xì)菌和真菌等微生物的鑒定發(fā)生了質(zhì)的變化。不同種、亞種甚至不同區(qū)域的微生物,都有自己的蛋白生物特征。MALDI-TOF MS能夠在較寬的質(zhì)量數(shù)范圍內(nèi)獲取微生物的蛋白信息,因而可以構(gòu)建微生物蛋白指紋圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。通過(guò)對(duì)微生物蛋白指紋圖譜的比對(duì),可以在短至幾秒內(nèi)完成對(duì)微生物的種、亞種等的鑒定。與分子生物學(xué)的另一大流派基因組學(xué)相比,MALDI-TOF MS靈敏度高,成本低,因而得以快速普及。

韓國(guó)一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)利用分子指紋分析的原理,對(duì)害蟲(chóng)幼蟲(chóng)鑒定進(jìn)行了嘗試。

如前所述,雖然僅憑肉眼,以形態(tài)學(xué)知識(shí)即可鑒定一些害蟲(chóng),但更多時(shí)候,通過(guò)形態(tài)學(xué)方法鑒定害蟲(chóng)成為難題,尤其是鑒定一些相近物種的幼蟲(chóng)時(shí)。雖然在實(shí)驗(yàn)室里,由專業(yè)團(tuán)隊(duì)通過(guò)形態(tài)學(xué)方法進(jìn)行物種鑒定,準(zhǔn)確率很高,但在實(shí)際應(yīng)用中,普通工作人員很難掌握形態(tài)學(xué)專業(yè)知識(shí)。

該韓國(guó)團(tuán)隊(duì)的研究對(duì)象是幾種水果食心蟲(chóng)(Carposina sasakii,Grapholita molesta和Grapholita dimorpha)。這幾種食心蟲(chóng)的幼蟲(chóng)長(zhǎng)得非常相近,是水果檢驗(yàn)檢疫中的難題之一,在進(jìn)出口環(huán)節(jié),稍有不慎便會(huì)發(fā)生有害物種入侵,對(duì)當(dāng)?shù)剞r(nóng)業(yè)造成巨大損失。

類同于微生物鑒定的原理,該研究團(tuán)隊(duì)使用MALDI-TOF MS分析了該三種幼蟲(chóng)的蛋白信息,建立相應(yīng)的蛋白指紋質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫(kù)之后,很好地實(shí)現(xiàn)了對(duì)這三種幼蟲(chóng)的鑒定,取樣量?jī)H為2立方毫米,從前處理到上機(jī)檢測(cè),數(shù)分鐘內(nèi)即可獲得物種鑒定結(jié)果。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在“Journal of Asia-Pacific Entomology”上。

可以想見(jiàn),不僅僅是微生物鑒定,對(duì)于檢驗(yàn)檢疫以及農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,利用相同的技術(shù)原理,MALDI-TOF MS 還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)害蟲(chóng)的物種鑒定,在經(jīng)濟(jì)作物病蟲(chóng)害防治、進(jìn)出口檢驗(yàn)檢疫中有廣闊的用武之地。

無(wú)獨(dú)有偶,融智生物也做了類似的工作,使用QuanTOF新一代寬譜定量飛行時(shí)間質(zhì)譜(新一代MALDI-TOF MS)技術(shù)代替形態(tài)學(xué)方法完成了對(duì)大閘蟹產(chǎn)地的鑒定、對(duì)大型食用真菌種類的鑒定、以及對(duì)豬肉品質(zhì)的鑒定等工作,對(duì)于食品安全具有非常重要的實(shí)際意義。

參考文獻(xiàn):

Rapid and reliable species identification of Carposina sasakii from its morphological homologues, by MALDI-TOF mass spectrometry. https://doi.org/10.1016/j.aspen.2017.02.013

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